東京城里有透明怪人的話題，被新聞媒體炒得沸沸揚揚。不久島田的珍珠寶塔被人盜走，接著明智大偵探夫婦相繼失蹤也變成透明人。一天，透明怪人團伙的首領(lǐng)怪老人被抓，盤問怪老人的審訊室里居然出現(xiàn)三個明智大偵探，這究竟是怎么回事？明智大偵探和少年偵探團能將犯罪嫌疑人繩之以法嗎？