農業(yè)轉基因生物安全管理部際聯席會議辦公室，主要職能是參與組織全國農業(yè)轉基因生物安全的監(jiān)督管理；參與國家農業(yè)轉基因生物安全評價與檢測機構的認證、管理和安全監(jiān)測體系建設；負責協調、落實國務院農業(yè)轉基因生物安全管理部際聯席會議決定事項；承辦農業(yè)部農業(yè)轉基因生物安全管理領導小組、國家農業(yè)轉基因生物安全委員會的日常工作等。